จากการจัดลำดับมหาวิทยาลัยโลก โดย Times Higher Education (THE) World University Ranking มหาวิทยาลัยมหิดล ได้รับการจัดลำดับในสาขาแพทยศาสตร์ (by subject Medicine) อยู่ในลำดับที่ 1 ของประเทศไทย ตั้งแต่ปี 2018 เป็นเวลา 8 ปีติดต่อกัน และจากการจัดลำดับโดย Quacquarelli Symonds (QS) World University Ranking มหาวิทยาลัยมหิดลอยู่ในลำดับที่ 1 ของประเทศไทยตั้งแต่ปี 2015 เป็นเวลา 11ปีติดต่อกัน โดยการจัดลำดับดังกล่าววัดจากคุณภาพการเรียนการสอน บรรยากาศและคุณภาพงานวิจัยและจำนวนการอ้างอิงผลงานวิจัย และภาพลักษณ์ในระดับนานาชาติ